「河川、湖泊及水庫水質採樣通則」（NIEA W104.51C）、
「監測井地下水採樣方法」（NIEA W103.54B）、
「水質檢測方法總則」（NIEA W102.51C）
為基本規範，前述通案規範未涵蓋部分，行政院環境保護署環境監測及資訊處依據監測目的需求訂定「行政院環境保護署環境水質監測採樣作業指引」。
各水體監測項目調整原則為符合法規標準要求及利於數據審查或污染原因研判。
分析作業以行政院環境保護署環境檢驗所公告「環境檢驗品質管制指引通則」(NIEA-PA101)、「水質檢測方法總則」(NIEA W102.51C)為基本規範，並以相關類別之檢驗方法進行各項水質檢測工作，惟環境水體基質複雜，水質污染物濃度範圍較難界定，為對檢測數據品質有較高之要求，部分特定項目之檢驗方法採較嚴格限制，
例如氨氮檢測不得使用氨選擇電極及消化法，硝酸鹽氮檢測不得使用馬錢子鹼方法，重金屬六價鉻不得使用MIBK萃取，透明度限定使用沙奇盤直徑30cm等等。有關目前各水體監測項目之檢驗方法如下列所示。
河川
監測項目
|
檢驗方法
|
方法說明
|
水溫
|
NIEA W217.51A
|
水溫檢測方法
|
酸鹼值
|
NIEA W424.52A
|
電極法
|
導電度
|
NIEA W203.51B
|
導電度計法
|
懸浮固體
|
NIEA W210.58A
|
103℃～105℃乾燥
|
氯鹽
|
NIEA W407.51C
|
硝酸銀滴定法
|
生化需氧量
|
NIEA W510.55B
|
水中生化需氧量檢測方法
|
化學需氧量
|
NIEA W515.54A
|
重鉻酸鉀迴流法
|
NIEA W516.55A
|
含高濃度鹵離子重鉻酸鉀迴流法
|
|
總有機碳
|
NIEA W532.52C
|
過氧焦硫酸鹽加熱氧化／ 紅外線測定法
|
氨氮
|
NIEA W448.51B
|
靛酚比色法
|
NIEA W437.52C
|
靛酚法
|
|
硝酸鹽氮
|
NIEA W415.53B
|
離子層析法
|
NIEA W436.52C
|
鎘還原流動注入分析法
|
|
亞硝酸鹽氮
|
NIEA W418.53C
|
分光光度計法
|
NIEA W436.52C
|
鎘還原流動注入分析法
|
|
溶氧
|
NIEA W455.52C
|
電極法
|
總磷
|
NIEA W427.53B
|
分光光度計／維生素丙法
|
大腸桿菌群
|
NIEA E202.55B
|
濾膜法
|
錳
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
鋅
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
銅
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
鉛
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
砷
|
NIEA W435.53B
|
批次氫化物原子吸收光譜法
|
NIEA W434.54B
|
自動化連續流動式氫化物原子吸收光譜法
|
|
鎘
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
汞
|
NIEA W330.52A
|
冷蒸氣原子吸收光譜法
|
硒
|
NIEA W340.51A
|
氫化硒原子吸收光譜法
|
NIEA W341.51B
|
自動化連續流動式氫化物原子吸收光譜法
|
|
銀
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
六價鉻
|
NIEA W320.52A
|
比色法
|
水庫
監測項目
|
檢驗方法
|
方法說明
|
水溫
|
NIEA W217.51A
|
水溫檢測方法
|
透明度
|
NIEA E220.51C
|
水體透明度測定方法
|
酸鹼值
|
NIEA W424.52A
|
電極法
|
濁度
|
NIEA W219.52C
|
濁度計法
|
導電度
|
NIEA W203.51B
|
導電度計法
|
懸浮固體
|
NIEA W210.58A
|
103℃～105℃乾燥
|
化學需氧量
|
NIEA W515.54A
|
重鉻酸鉀迴流法
|
總有機碳
|
NIEA W532.52C
|
過氧焦硫酸鹽加熱氧化／ 紅外線測定法
|
氨氮
|
NIEA W437.52C
|
靛酚法
|
NIEA W448.51B
|
靛酚比色法
|
|
硝酸鹽氮
|
NIEA W436.52C
|
鎘還原流動注入分析法
|
NIEA W415.53B
|
離子層析法
|
|
亞硝酸鹽氮
|
NIEA W418.53C
|
分光光度計法
|
NIEA W436.52C
|
鎘還原流動注入分析法
|
|
總硬度
|
NIEA W208.51A
|
EDTA滴定法
|
總鹼度
|
NIEA W449.00B
|
滴定法
|
正磷酸鹽
|
NIEA W427.53B
|
分光光度計／維生素丙法
|
總磷
|
NIEA W427.53B
|
分光光度計／維生素丙法
|
溶氧
|
NIEA W455.52C
|
電極法
|
葉綠素a
|
NIEA E507.03B
|
丙酮萃取法
|
地下水
監測項目
|
檢驗方法
|
方法說明
|
水溫
|
NIEA W217.51A
|
水溫檢測方法
|
酸鹼值
|
NIEA W424.52A
|
電極法
|
導電度
|
NIEA W203.51B
|
導電度計法
|
總溶解固體
|
NIEA W210.58A
|
103℃～105℃乾燥
|
總有機碳
|
NIEA W532.52C
|
過氧焦硫酸鹽加熱氧化／ 紅外線測定法
|
氨氮
|
NIEA W448.51B
|
靛酚比色法
|
NIEA W437.52C
|
靛酚法
|
|
硝酸鹽氮
|
NIEA W415.53B
|
離子層析法
|
NIEA W436.52C
|
鎘還原流動注入分析法
|
|
總硬度
|
NIEA W208.51A
|
EDTA滴定法
|
鹼度
|
NIEA W449.00B
|
滴定法
|
硫酸鹽
|
NIEA W430.51C
|
濁度法
|
NIEA W415.53B
|
離子層析法
|
|
氯鹽
|
NIEA W407.51C
|
硝酸銀滴定法
|
NIEA W415.53B
|
離子層析法
|
|
鈣
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA M104.02C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
鎂
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA M104.02C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
鈉
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA M104.02C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
鉀
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA M104.02C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
鐵
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
錳
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
鋅
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
銅
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
鉻
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
|
鉛
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
砷
|
NIEA W434.54B
|
自動化連續流動式氫化物原子吸收光譜法
|
NIEA W435.53B
|
批次氫化物原子吸收光譜法
|
|
鎘
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
汞
|
NIEA W330.52A
|
冷蒸氣原子吸收光譜法
|
鎳
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
氟鹽
|
NIEA W413.52A
|
氟選擇性電極法
|
總酚
|
NIEA W521.52A
|
分光光度計法
|
苯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
甲苯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
乙苯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
二甲苯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
萘
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
四氯化碳
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
氯苯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
氯仿
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
氯甲烷
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
1,4-二氯苯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
1,1-二氯乙烷
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
1,2-二氯乙烷
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
1,1-二氯乙烯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
順-1,2-二氯乙烯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
反-1,2-二氯乙烯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
四氯乙烯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
三氯乙烯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
氯乙烯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
二氯甲烷
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
1,1,2-三氯乙烷
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
1,2-二氯苯
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
1,1,1-三氯乙烷
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
甲基第三丁基醚
|
NIEA W785.55B
|
吹氣捕捉／氣相層析質譜儀法
|
海域
監測項目
|
檢驗方法
|
方法說明
|
水溫
|
NIEA W217.51A
|
水溫檢測方法
|
酸鹼值
|
NIEA W424.52A
|
電極法
|
懸浮固體
|
NIEA W210.58A
|
103℃～105℃乾燥
|
氨氮
|
NIEA W448.51B
|
靛酚比色法
|
NIEA W437.52C
|
靛酚法
|
|
硝酸鹽氮
|
NIEA W415.53B
|
離子層析法
|
NIEA W436.52C
|
鎘還原流動注入分析法
|
|
亞硝酸鹽氮
|
NIEA W436.52C
|
鎘還原流動注入分析法
|
NIEA W418.53C
|
分光光度計法
|
|
鹽度
|
NIEA W447.20C
|
導電度法
|
溶氧
|
NIEA W455.52C
|
電極法
|
正磷酸鹽
|
NIEA W427.53B
|
分光光度計／維生素丙法
|
葉綠素a
|
NIEA E507.03B
|
丙酮萃取法
|
鋅
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
|
銅
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
鉻
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
|
鉛
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
|
鎘
|
NIEA W308.22B
|
鉗合離子交換樹脂濃縮法
|
NIEA W311.53C
|
感應耦合電漿原子發射光譜法
|
|
NIEA W313.53B
|
感應耦合電漿質譜法
|
|
汞
|
NIEA W330.52A
|
冷蒸氣原子吸收光譜法
|
海灘
監測項目
|
檢驗方法
|
方法說明
|
水溫
|
NIEA W217.51A
|
水溫檢測方法
|
酸鹼值
|
NIEA W424.52A
|
電極法
|
鹽度
|
NIEA W447.20C
|
導電度法
|
大腸桿菌群
|
NIEA E202.55B
|
濾膜法
|
腸球菌群
|
NIEA E235.51C
|
螢光酵素檢測法
|
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